Les différentes structures de pilotage ont un objectif double : favoriser un pilotage global et opérer des choix collectifs en vue de construire et exploiter un SI partagé entre les MSA.

Le système d'information partagé est construit sur un système de décision transparent. Ce système porte des choix d'option collectifs avec une subsidiarité des niveaux de décision. Les rôles des structures de pilotage ont ainsi été clairement définis :

Conseil Central d'Administration

Sur proposition de la CSI, le Conseil Central d'Administration de la CCMSA définit les grands axes d'évolution du Schéma Directeur Informatique (SDI).

Commission de la Stratégie Institutionnelle (CSI)

La CSI est chargée de coordonner l'élaboration du projet stratégique. Elle en assure le suivi en proposant, autant que de besoin, au conseil d'administration de la caisse centrale, les décisions susceptibles d'assurer sa mise en oeuvre et de garantir une cohérence d'ensemble entre choix institutionnels, engagements contractuels de la Convention d'Objectifs et de Gestion (COG) et orientations du Schéma Directeur Informatique (SDI).

Elle emet un avis sur le projet de COG et de SDI.

Comité Directeur de l'Informatique Institutionnelle (CD2I)

Le CD2I valide les propositions d'actions et de budgets associés dans le cadre des orientations du SDI.

Il administre les 2 structures MEI et MOI et élabore la stratégie informatique de l'institution. Il définit également les orientations, examine les propositions et arbitre en cas de désaccord au CRI.

Comité des Régions Informatiques (CRI)

Le CRI est le lieu d'expression des besoins et des priorités. Il prépare les décisions du CD2I, synthétise et harmonise les besoins des Caisses et de la Caisse Centrale.

Groupes d'Orientation du CRI (GO CRI)

Il existe 5 groupes correspondant aux 5 grands domaines applicatifs : Services aux Assurés, Santé, Gestion Interne, Architecture et Services aux Entreprises.

Directement rattaché au CRI, ils sont le point de passage obligé pour les investissements. Ils opèrent des choix collectifs après débats sur le fond entre les acteurs MSA et CCMSA, produisent des argumentaires qui fondent les décisions, examinent les études d'opportunités, examinent les études préalables et les propositions issues des Comité Utilisateurs des Produits (CUP) après le tri effectué par le Comité des Directeurs Techniques (CDT).

Ils donnent les orientations pour faciliter les arbitrages nécessaires au CRI.

Comité de Lancement et de Suivi des Projets (CLSP)

Le Comité de Lancement et de Suivi des Projets réunit les directions MO et ME pour le pilotage opérationnel du SI qui leur est confié.

COPIDOMOI

Le COPIDOMOI est une structure spécifique à la caisse centrale pour les échanges, les coordinations et le partage d’information au sein de celle-ci. 
Il recueille les demandes institutionnelles, s’assure de la complétude des descriptifs et planifie les approfondissements.

Les Caisses Maîtrises d'Ouvrage (CMO)

Une Caisse MO est une caisse à qui est confiée la responsabilité d'une application en terme de mise à niveau et suivi MO ainsi que la direction de projet sur ses thèmes de compétence. Ainsi, elle porte les projets impactant directement cette application.

Le Directeur de domaine

Il coordonne l'ensemble du parc applicatif et du portefeuille des projets du domaine.